جستجو
Persian
همه دسته بندی ها
    منو بسته

    آموزش شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از LAMMPS (شیمی)

    مدت دوره (ساعت) : 8
    فروشنده: دپارتمان شیمی
    390,000 تومان
    i h

    شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) که امروزه در بیندانشجویان، پژوهشگران و فعالان در حوزه فیزیک، مهندسی شیمی، مهندسی مواد و متالورژی، مکانیک، عمران، زیست شناسی، بایوتکنولوژی، پزشکی، دندانپزشکی و ...جایگاه ویژه خود را پیدا کرده اول از همه با نرم افزار LAMMPS برای مدلسازی و آنالیز شناخته می شود.

    برای بررسی پدیده ها و فرایندها چه در ابعاد میکروسکوپی و چه در ابعاد ماکروسکوپی، نیاز به شروع بررسی از مقیاس اتمی می باشد. به عنوان مثال به منظور بررسی و آنالیز یک ترک در بال هواپیما که در اثر فاصله گرفتن اتم ها از هم ایجاد شده است و یا به منظور بررسی دارورسانی به یک غده سرطانی با در نظر گرفتن دارو به صورت اتمی و انجام شبیه سازی مولکولی، میتوان اندرکنش های رخ داده را پیش بینی کرد.

    دینامیک مولکولی را می توان برای کشف فضای ساختاری استفاده کرد و اغلب روش انتخابی برای مولکول های بزرگ مانند پروتئین ها است. در دینامیک مولکولی، سطح انرژی با حل قوانین حرکت نیوتن برای سیستم مورد بررسی قرار می گیرد. 

    مطالعات دینامیک مولکولی(MD) روی مولکول‌های زیستی به توانایی شبیه‌سازی سیستم‌های پیچیده بیوشیمیایی با تعداد فزاینده‌ای از ذرات و برای مقیاس‌های زمانی طولانی‌تر نیاز دارد، مشکلی که نمی‌توان با پیشرفت‌های سخت‌افزار محاسباتی به تنهایی بر آن غلبه کرد.

    بنابراین در شبیه سازی دینامیک مولکولی به کمک نرم افزاری مانند Lammps اندرکنش میان اتم ها و مولکول ها در بازه‌هایی از زمان بر اساس قوانین فیزیک مورد بررسی قرار می گیرد. و اینکه شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم افزارهای متفاوتی انجام میشود. رایج ترین نرم افزار این حوزه در دنیا، Material Studio نام دارد که به دلیل مشکلات لایسنس در ایران قابل استفاده و استناد نیست. 
     LAMMPS بی شک یکی از کارآمدترین نرم افزارهای حوزه MD است. در توضیح این کارآمدی میتوان یادآوری کرد در شبیه سازی دینامیک مولکولی ما به تعریف ساختار اتمی و میدان نیروها نیاز داریم. از آنجایی که چینش بین اتم ها اهمیت زیادی دارد، تعریف میدان نیروها از مهمترین مباحث به شمار میرود. بنابراین وجود میدان های متنوع باعث تفاوت در بین نرم افزارها میشود. برتری  نرم افزار LAMMPS به دلیل وجود انواع میدان های نیرویی در حوزه های مختلف است.

    1- آشنایی مقدماتی با نرم افزار لمپس
    2- ویژگی های نرم افزا لمپس
    3-نقاط مثبت ومنفی نرم افزار لمپس
    4- آشنایی با نرم افزار های گرافیکی مانند VMD5
    5- خروجی های نرم افزار لمپس
    6- قواعد کدنویسی با نرم افزار لمپس
    7- نحوه نصب و اجرای نرم افزار در محیط ویندوز
    8- تحلیل نمونه کدهای شبیه سازی لمپس

    مشخصات محصولات
    شرکت CAST
    پیش نیاز ندارد
    وضعیت پیش ثبت نام
    نحوه برگزاری آنلاین و حضوری
    نوع دوره فشرده
    فیلم دوره موجود است
    مدرک ارائه شده لاتین پارس پژوهان
    5.0 1
    نقد و بررسی خود را بنویسید بستن
    *
    *
    • بد
    • عالی
    علیرضا | 1401/03/29 11:23
    دوره لمپس
    پشتیبانی مناسب پارس پژوهان و تدریس استاد از نقاط قوت دوره شبیه سازی دینامیک مولکولی بود.
    آیا این نقد و بررسی مفید بود؟ بله خیر (0/0)
    *
    *
    *

    شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) که امروزه در بیندانشجویان، پژوهشگران و فعالان در حوزه فیزیک، مهندسی شیمی، مهندسی مواد و متالورژی، مکانیک، عمران، زیست شناسی، بایوتکنولوژی، پزشکی، دندانپزشکی و ...جایگاه ویژه خود را پیدا کرده اول از همه با نرم افزار LAMMPS برای مدلسازی و آنالیز شناخته می شود.

    برای بررسی پدیده ها و فرایندها چه در ابعاد میکروسکوپی و چه در ابعاد ماکروسکوپی، نیاز به شروع بررسی از مقیاس اتمی می باشد. به عنوان مثال به منظور بررسی و آنالیز یک ترک در بال هواپیما که در اثر فاصله گرفتن اتم ها از هم ایجاد شده است و یا به منظور بررسی دارورسانی به یک غده سرطانی با در نظر گرفتن دارو به صورت اتمی و انجام شبیه سازی مولکولی، میتوان اندرکنش های رخ داده را پیش بینی کرد.

    دینامیک مولکولی را می توان برای کشف فضای ساختاری استفاده کرد و اغلب روش انتخابی برای مولکول های بزرگ مانند پروتئین ها است. در دینامیک مولکولی، سطح انرژی با حل قوانین حرکت نیوتن برای سیستم مورد بررسی قرار می گیرد. 

    مطالعات دینامیک مولکولی(MD) روی مولکول‌های زیستی به توانایی شبیه‌سازی سیستم‌های پیچیده بیوشیمیایی با تعداد فزاینده‌ای از ذرات و برای مقیاس‌های زمانی طولانی‌تر نیاز دارد، مشکلی که نمی‌توان با پیشرفت‌های سخت‌افزار محاسباتی به تنهایی بر آن غلبه کرد.

    بنابراین در شبیه سازی دینامیک مولکولی به کمک نرم افزاری مانند Lammps اندرکنش میان اتم ها و مولکول ها در بازه‌هایی از زمان بر اساس قوانین فیزیک مورد بررسی قرار می گیرد. و اینکه شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم افزارهای متفاوتی انجام میشود. رایج ترین نرم افزار این حوزه در دنیا، Material Studio نام دارد که به دلیل مشکلات لایسنس در ایران قابل استفاده و استناد نیست. 
     LAMMPS بی شک یکی از کارآمدترین نرم افزارهای حوزه MD است. در توضیح این کارآمدی میتوان یادآوری کرد در شبیه سازی دینامیک مولکولی ما به تعریف ساختار اتمی و میدان نیروها نیاز داریم. از آنجایی که چینش بین اتم ها اهمیت زیادی دارد، تعریف میدان نیروها از مهمترین مباحث به شمار میرود. بنابراین وجود میدان های متنوع باعث تفاوت در بین نرم افزارها میشود. برتری  نرم افزار LAMMPS به دلیل وجود انواع میدان های نیرویی در حوزه های مختلف است.

    مشخصات محصولات
    شرکت CAST
    پیش نیاز ندارد
    وضعیت پیش ثبت نام
    نحوه برگزاری آنلاین و حضوری
    نوع دوره فشرده
    فیلم دوره موجود است
    مدرک ارائه شده لاتین پارس پژوهان