دپارتمان مهندسی پزشکی، یکی از دپارتمان ها در گروه آموزشی پارس پژوهان است. در حال حاضر بالغ بر 22 کد دوره به صورت ترمیک و فشرده در این دپارتمان وجود دارد. این دپارتمان در قالب 3 شاخه اصلی خدمات خود را به دانشجویان و توانبخشان و فعالان در حوزه مهندسی پزشکی و رشته های مرتبط ارائه می دهد. این سه شاخه عبارتند از: بایومکانیک، بایوالکتریک و بایومتریال.